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Ruby 可视化转录因子与 DNA 结合验证试剂盒

Ruby 可视化转录因子与 DNA 结合验证试剂盒  Ruby:ruby 报告系统可表达 3 个酶蛋白(CYP76AD1,DODA、GT),三个酶蛋白将底物酪氨酸分
解形成肉眼可见的玫红色的甜菜红素。对于双荧光素酶报告系统(Dual-LUC),需要添加底物与使用化学 发光酶标仪检测其表达量。而酪氨酸作为植物的天然底物不需要人为添加底物,即可原位显色。
uvGFP:uvGFP 在 365nm 激发光源下可产生肉眼可见的绿色荧光,该荧光比 eGFP 强几十倍,观察时无需滤光片。
将待验证的 DNA 序列构建在 ruby(uvGFP 此时就作为内参,由强启动子启动表达)或者 uvGFP(ruby此时作为内参,由强启动子启动表达)报告基因的上游,利用 pGreenll62-SK 载体表达转录因子。若转录因子与 DNA 结合,将启动下游报告基因的表达,通过观察颜色(ruby 表达产生红色)或者荧光(uvGFP表达产生绿色荧光),检查其是否互做。此系统主要用于定性分析。
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    Ruby 可视化转录因子与 DNA 结合验证试剂盒

    产品货号: hyypb2194

    储存条件: 请按产品包装要求储存

    产品名称

     

    规格

     

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    pGreenII 62-SK

     

    10ul质粒

    -20℃

     

    62SK-uvGFP-no-pro-Ruby

     

    10ul质粒

    -20℃

     

    62-SK-5xUAS-ruby

     

    10ul质粒

    -20℃

     

    pGreenll 62-SK-GAL4-VP16

     

    10ul质粒

    -20℃

     

    5×农杆菌侵染液

     

    10ul质粒

    4℃

     

    365nm 紫外手电筒

     

    个

    RT

    注:载体构建相关试剂需自备。

    Ruby 可视化转录因子与 DNA 结合验证试剂盒

    产品简介:

    Ruby:ruby 报告系统可表达 3 个酶蛋白(CYP76AD1,DODA、GT),三个酶蛋白将底物酪氨酸分

    解形成肉眼可见的玫红色的甜菜红素。对于双荧光素酶报告系统(Dual-LUC),需要添加底物与使用化学 发光酶标仪检测其表达量。而酪氨酸作为植物的天然底物不需要人为添加底物,即可原位显色。

    uvGFP:uvGFP 在 365nm 激发光源下可产生肉眼可见的绿色荧光,该荧光比 eGFP 强几十倍,观察时无需滤光片。

    将待验证的 DNA 序列构建在 ruby(uvGFP 此时就作为内参,由强启动子启动表达)或者 uvGFP(ruby此时作为内参,由强启动子启动表达)报告基因的上游,利用 pGreenll62-SK 载体表达转录因子。若转录因子与 DNA 结合,将启动下游报告基因的表达,通过观察颜色(ruby 表达产生红色)或者荧光(uvGFP表达产生绿色荧光),检查其是否互做。此系统主要用于定性分析。

    注意事项:

    1.本产品提供了荧光素酶报告基因实验的方案,具体操作可根据自己试验的实际情况对相关内容进行调整。

    2.本产品不提供的感受态及其它试剂可以在本司单独购买。

    3.虽然本产品操作步骤以烟草为例,但实际可尝试应用于更多荧光素酶报告基因受体植物。

    4.质粒建议重新转化大肠杆菌扩繁,提取质粒后使用。

    使用说明(仅供参考):

    一、载体构建

    将所研究的启动子序列构建到 62SK-uvGFP-no-pro-Ruby 载体 MCS 区(卡那抗性);将所研究的目标蛋白的 CDS 序列构建到 pGreenII 62-SK 载体 MCS 区(卡那抗性)。

    载体

    同源臂

    鉴定引物

    酶切位点

    62SK-uvGFP-no-

    pro-Ruby

    F:CCAATATATCCTGTCAGAATTC

    F:CTCTGACTTGAGCGTCGATT

    EcoRI

    R:CGAGGGTCGCATGATCCATA

    R:AACAGCAGCTTGATGAAGTG

    SpeI

    pGreenII 62-SK

    F:TCCCCCGGGCTGCAGGAATTC

    F:GACGCACAATCCCACTATCC

    EcoRI

    R:GTCGACGGTATCGATAAGCTT

    R:ACCCTAATTTCCCTTATCGGG

    HindIII

    Ruby 可视化转录因子与 DNA 结合验证试剂盒

    二、烟草注射

    1. 转化农杆菌:

    将 pGreenll62-SK-TF、62SK-uvGFP-genepro-Ruby、pGreenll 62-SK-GAL4-VP16、62-SK-5xUAS-ruby、

    pGreenll 62-SK 分别转化农杆菌感受态细胞 GV3101(psoup-p19),涂布 YEB 平板(50μg/mL Kan、10μg/mLRif),28℃培养 3 天。

    2. 鉴定及摇菌:

    鉴定目的基因阳性克隆,并挑取单菌落于 3mL 的 YEB 培养基中(含 50μg/mL Kan 和 10μg/mL Rif),

    过夜培养 14-18 h。

    3. 配制 Activation Buffer:

    在无菌条件下,用 ddH2O 将 5×农杆菌侵染液稀释为 l×工作液,每 10mL 工作液加入 10μL 乙酰丁香酮(100 mM)混匀,即为 Activation Buffer,备用。

    注:Activation Buffer 需要现配现用,根据第 2 步菌液的体积配置合适体积的 Activation Buffer。

    4. 收集、重悬菌体:

    取 2mL 摇至浑浊的农杆菌菌液(OD600=1.0~1.5),5000 rpm 离心 10min,弃去上清,用 Activation Buffer重悬菌体,调至 OD600=0.8。

    5. 混菌:

    实验组按照下表 1:1 体积混合两种菌体,黑暗下静置 2-4h。

    实验组

    pGreenll62-SK-TF

    62SK-uvGFP-genepro-Ruby

    空白对照组

    pGreenll62-SK

    62SK-uvGFP-genepro-Ruby

    阳性组

    pGreenll 62-SK-GAL4-VP16

    62-SK-5xUAS-ruby

    阴性组

    pGreenll 62-SK

    62-SK-5xUAS-ruby

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    6. 注射法侵染烟草叶片:

    使用 1mL 无菌注射器吸取上一步得到的重悬液,避开烟草叶脉,确认要注射的区域,先用注射器

    针头在要注射的区域边缘轻微划一下,造成“微创”,注意不要划破叶片,左手抵在叶片的正面,右手将注射器(不带针头)垂直压在叶片的背面,右手拇指慢慢推压注射器,观察菌液在表皮下扩散到一定范围(具体范围视烟草叶片大小而定,若多组注射在同一叶片时,务必使扩散范围互不影响)。注射完于温室中暗培养 48-72h,根据实验需求进行后续实验。

    同一株烟草选取 2-3 个叶片进行注射。同一批试验建议至少注射 3 株烟草。

    注:最好选择 4-5 周龄健康的本氏烟进行注射(太小的叶片不容易注射,太老的叶片表达效率较低),

    如注射范围较大,需额外多配制菌液。

     

    三、结果

    首先查看 365nm 灯照下四个组注射点的 uvGFP 内参是否正常表达荧光,若正常显色表明瞬时转化成功。

    有互做:空白对照组 ruby 未表达,实验组 ruby 表达,显示红色,内参 uvGFP 显示绿色荧光。

    无互做:空白对照组和实验组内参 uvGFP 显示绿色荧光,报告基因 ruby 不显色。

    有自激活:空白对照组和实验组 ruby 都有表达,显示红色,内参 uvGFP 显示绿色荧光。

    注:实验中会发现 Ruby 表达量高时,玫红色很深,此时 uvGFP 显色浅,是正常现象,uvGFP 需要从烟草叶片背面观察。

    注射后大约 5-7 天观察为佳,因为 uvGFP 显色慢于 ruby,时间短 uvGFP 显色不强。时间长则 ruby 本底表

     

    达会过多积累。

    阴性/自激活组的 Ruby,在时间超过 6 天,会有一点轻微的本底表达显色,但其颜色显著低于阳性组,此为正常现象。

    具体最佳显色时间与每一次的实验细节与烟草状态决定,可以在 4 天后,每天观察

     

    下图为例:注射后 7 天观察(左图为明场观察,右图为 365nm 紫外激发下观察)

    左上:实验组,显色明显,蛋白 A 与 B 有互作。

    左下:空白对照组,有轻微的红色,本底表达正常现象。

    右上:阳性组,因为 ruby 表达的色素太深,导致 uvGFP 显色不强。

    右下:阴性对照组,有轻微的红色,本底表达正常现象

    Ruby 可视化转录因子与 DNA 结合验证试剂盒

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