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Ruby 可视化蛋白互作验证试剂盒

Ruby 可视化蛋白互作验证试剂盒
产品简介:

Gal4-VP16-UAS 系统:Gal4-VP16 融合蛋白(Gal4:结合域,VP16:激活域)能够结合 UAS 序列元件,启动下游报告基因表达。将两个结构域分开表达,若两个结构域能在空间上接近,则形成完整蛋白,结合 UAS 并激活下游报告基因表达。

Ruby:ruby 报告系统可表达 3 个酶蛋白(CYP76AD1 、DODA 、GT),三个酶蛋白将底物酪氨酸分解形成肉眼可见的玫红色的甜菜红素。而酪氨酸作为植物的天然底物不需要人为添加底物,即可原位显色。
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Hyybp8105 
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  • Ruby 可视化蛋白互作验证试剂盒

     

    货号:Hyybp8105         规格:1Set

     

    储存条件: 请按产品包装要求储存

     

    产品组分:

     

    产品名称

    规格

    保存

    pGreenll 62-SK-GAL4

    10μl 质粒

    -20℃

    pGreenll 62-SK-VP16

    10μl 质粒

    -20℃

    62-SK-5xUAS-ruby

    10μl 质粒

    -20℃

    pGreenll 62-SK-GAL4-VP16

    10μl 质粒

    -20℃

    5×农杆菌侵染液

    80ml

    4℃

    365nm 紫外手电筒

    个

    常温

    说明书

    1份

    注:载体构建相关试剂需自备。

    产品简介:

    Gal4-VP16-UAS 系统:Gal4-VP16 融合蛋白(Gal4:结合域,VP16:激活域)能够结合 UAS 序列元件,启动下游报告基因表达。将两个结构域分开表达,若两个结构域能在空间上接近,则形成完整蛋白,结合 UAS 并激活下游报告基因表达。

    Ruby:ruby 报告系统可表达 3 个酶蛋白(CYP76AD1 、DODA 、GT),三个酶蛋白将底物酪氨酸分解形成肉眼可见的玫红色的甜菜红素。而酪氨酸作为植物的天然底物不需要人为添加底物,即可原位显色。

    uvGFP:uvGFP 在 365nm激发光源下可产生肉眼可见的绿色荧光,该荧光比 eGFP 强几十倍,观察时无需滤光片。

    互作验证:ruby 报告基因前面构建有 5xUAS 序列。将蛋白A 与Gal4 融合表达,蛋白 B 与 VP16 融合表达,若 A 与 B 能形成互作,拉近 Gal4-VP16 形成完整蛋白,结合到 5xUAS 序列上,启动下游ruby 基因表达,形成肉眼可见的玫红色色素。此外,报告载体上面还有uvGFP 表达框。uvGFP 基因前面为组成性强启动子,可作为内参,用于参考瞬时转化是否成功。

    Ruby 可视化蛋白互作验证试剂盒

    使用说明(仅供参考):

    一、载体构建

    将所研究的两个目标蛋白(蛋白 A 、蛋白B)的 CDS 序列分别构建到 pGreenll 62-SK-GAL4 载体(卡那抗性)的 GAL4 区域的下游 MCS 处和 pGreenll 62-SK-VP16 载体(卡那抗性)的 VP16 区域的下游 MCS处,即为 pGreenll 62-SK-GAL4-蛋白 A 、pGreenll 62-SK-VP16-蛋白 B。

    注:1.  载体构建时插入片段与GAL4 或 VP16 要保持同一阅读框,保证插入片段融合表达。

    2.  该对载体的 MCS 在 GAL4/VP16 的 C 端,构建时需要保留止密码子。

                                                                                        

     

    载体

    同源臂

    鉴定引物

    酶切位点

    pGreenll

    62-SK-GAL4

    F:CGGCCGCTCTAGAACTAGTG

    F:GTCACAGATAGATTGGCTTC

    SpeI

    R:GTCGACGGTATCGATAAGCTT

    R:GCTCAACACATGAGCGAAAC

    HindIII

    pGreenll

    62-SK-VP16

    F:CGGCCGCTCTAGAACTAGTG

    F:ACGATTTCGATCTGGACATG

    SpeI

    R:GTCGACGGTATCGATAAGCTT

    R:GCTCAACACATGAGCGAAAC

    HindIII

    二、烟草注射

    1.  转化农杆菌:

    将 pGreenll 62-SK-GAL4-蛋白 1 、pGreenll 62-SK-VP16-蛋白 2 、pGreenll 62-SK-GAL4 、pGreenll

    62-SK-VP16 、62-SK-5xUAS-ruby 、pGreenll 62-SK-GAL4-VP16 分别转化农杆菌感受态细胞 GV3101 (psoup-p19),涂布 YEB 平板(50μg/mL Kan 、10μg/mL Rif),28℃培养 3 天。

    2.  鉴定及摇菌:

    鉴定目的基因阳性克隆,并挑取单菌落于 3mL 的 YEB 培养基中(含 50μg/mL Kan 和 10μg/mL Rif),过夜培养 14- 18 h。

    3.  配制 Activation Buffer:

    在无菌条件下,用 ddH2O 将 5×农杆菌侵染液稀释为 l×工作液,每 10mL 工作液加入 10μL 乙酰丁香酮(100 mM)混匀,即为 Activation Buffer ,备用。

    注:Activation Buffer 需要现配现用,根据第 2 步菌液的体积配置合适体积的 Activation Buffer。

    4.  收集、重悬菌体:

    取 2mL 摇至浑浊的农杆菌菌液(OD600= 1.0~ 1.5),5000 rpm 离心 10min,弃去上清,用 Activation Buffer重悬菌体,调至 OD600=0.8。

    5.  混菌:

    实验组按照下表 1:1:1 体积混合两种菌体,黑暗下静置 2-4h 。(阳性对照组合与实验组相同,不再赘述。)

    阳性组

    pGreenll 62-SK-GAL4-VP16

    /

    62-SK-5xUAS-ruby

    实验组

    pGreenll 62-SK-GAL4-蛋白 1

    pGreenll 62-SK-VP16-蛋白 2

    62-SK-5xUAS-ruby

    自激活组 1

    pGreenll 62-SK-GAL4-蛋白 1

    pGreenll 62-SK-VP16

    62-SK-5xUAS-ruby

    自激活组 2

    pGreenll 62-SK-GAL4

    pGreenll 62-SK-VP16-蛋白 2

    62-SK-5xUAS-ruby

    6.  注射法侵染烟草叶片:

    使用 1mL 无菌注射器吸取上一步得到的重悬液,避开烟草叶脉,确认要注射的区域,先用注射器针头在要注射的区域边缘轻微划一下,造成“微创” ,注意不要划破叶片,左手抵在叶片的正面,右手将注射器(不带针头)垂直压在叶片的背面,右手拇指慢慢推压注射器,观察菌液在表皮下扩散到一定范围(具体范围视烟草叶片大小而定,若多组注射在同一叶片时,务必使扩散范围互不影响)。注射完于温室中暗培养 48-72h ,根据实验需求进行后续实验。

    同一株烟草选取 2-3 个叶片进行注射。同一批试验建议至少注射 3 株烟草。

    注:最好选择 4-5 周龄健康的本氏烟进行注射(太小的叶片不容易注射,太老的叶片表达效率较低)

    如注射范围较大,需额外多配制菌液。

    Ruby 可视化蛋白互作验证试剂盒

    三、结果观察

    首先查看 365nm灯照下四个组注射点的 uvGFP 内参是否正常表达荧光,若正常显色表明瞬时转化成功。

    有互作:实验组ruby 表达,显示红色, 内参 uvGFP 显示绿色荧光。

    无互作:实验组内参 uvGFP 显示绿色荧光,报告基因ruby 不显色。

    无自激活(两个自激活组的ruby 不显色)。

    有自激活(两个自激活组的ruby 显色)。

    将蛋白A 与蛋白B 互换构建,即:蛋白A 与 VP16 融合。蛋白 B 与 Gal4 融合。

    注:实验中会发现 Ruby 表达量高时,玫红色很深,此时 uvGFP 显色浅,是正常现象,uvGFP 需要从烟草叶片背面观察。

    注射后大约 5-7 天观察为佳,因为uvGFP 显色慢于ruby ,时间短 uvGFP 显色不强。时间长则ruby 本底表达会过多积累。

    阴性/自激活组的 Ruby ,在时间超过 6 天,会有一点轻微的本底表达显色,但其颜色显著低于阳性组,此为正常现象。

    具体最佳显色时间与每一次的实验细节与烟草状态决定,可以在 4 天后,每天观察。

     

    下图为例:注射后 7 天观察(左图为明场观察,右图为 365nm 紫外激发下观察)

    左上:实验组,显色明显,蛋白A 与 B 有互作。

    右上:阳性组,因为ruby 表达的色素太深,导致 uvGFP 显色不强。

    左下: 自激活组 1 ,有轻微的红色,本底表达正常现象。

    右下: 自激活组 2 ,有轻微的红色,本底表达正常现象。

    Ruby 可视化蛋白互作验证试剂盒

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